L'humanité se déplace aujourd'hui comme si le coronavirus apparu en 2019 ne circulait plus sur la planète. Il n'y a pas de confinement ni de restriction de voyage. Il n'y a pas non plus d' utilisation massive de la jugulaire ou de la ventilation transversale dans les espaces clos . Mais l'agent pathogène est toujours là , il évolue et a donné naissance à de nouvelles sous-lignées du variant Ómicron.
Entre la seconde quinzaine de juillet et la première quinzaine d'août, plus de 1,4 million de nouveaux cas de COVID-19 ont été signalés dans le monde . C'est-à-dire qu'il y a eu une augmentation de 63% par rapport aux 28 jours précédents.
Au cours des deux dernières semaines, l' Organisation mondiale de la santé (OMS) a dû mettre à jour le système de classification des sous-lignées microniques : elle en compte désormais 7 en surveillance et 3 dans la catégorie "d'intérêt". Des experts des États-Unis et d'Argentine ont expliqué à Infobae ce que l'état actuel de la pandémie implique.
Les deux derniers à rejoindre la liste ont suscité l'inquiétude des experts qui enquêtent sur l'évolution du virus. L'un d'eux est EG.5, populairement appelé Eris, qui a été déclaré «d'intérêt» et à faible risque. Déjà la plupart des cas de COVID aux États-Unis sont dus à Eris. Il a été détecté dans 52 pays, dont l'Argentine, l'Équateur, la Colombie et le Mexique.
Mais voilà que la sous-lignée BA.2.86 est apparue et en quelques jours elle est devenue l'une des variantes de surveillance en circulation pour l'agence sanitaire car il est frappant qu'elle comporte plus de 30 mutations supplémentaires par rapport à la première version d'Ómicron. .
Il a été détecté le 24 juillet chez des patients COVID en Israël. Elle a ensuite été identifiée le 31 juillet au Danemark. Cette semaine, ils l'ont trouvé chez des patients aux États-Unis et au Royaume-Uni.
BA.2.86 est la "sous-variante la plus étonnante que le monde ait vue depuis le micron", a déclaré le professeur François Balloux, professeur de biologie des systèmes computationnels et directeur de l'Institut de génétique de l'UCL au Royaume-Uni .
Les séquences chargées de la sous-lignée "montrent une certaine diversité génétique, suggérant que la lignée circule depuis des mois", a-t-il déclaré. Le point préoccupant est que la plupart des mutations de la nouvelle sous-variante se trouvent dans la protéine Spike, et elle pourrait être en mesure d'échapper à davantage d'anticorps générés par l'infection ou par les vaccinations.
Le chercheur principal en immunologie à Conicet en Argentine , le Dr Jorge Geffner, a un autre regard : « Le nombre de mutations est frappant et c'est pourquoi il est bon que je fasse un suivi global. Mais les données sont encore très préliminaires. Il reste à voir comment ces mutations BA.2.86 impactent leur comportement biologique. Il s'agit de sa capacité infectieuse, de sa transmissibilité, de sa capacité à échapper à la réponse immunitaire et de la gravité de la maladie qu'elle provoque. Nous avons besoin de plus de données », a-t-il déclaré lorsqu'il a été consulté par Infobae .
Dans ce contexte actuel, le Dr Geffner -directeur par intérim de l'Institut de recherche biomédicale sur les rétrovirus et le sida (INBIRS) de Conicet et de l'Université de Buenos Aires-, a expliqué que "bien qu'il n'y ait pas d'urgence sanitaire, les gens doivent quand même considérer que l'infection continue d'être diagnostiquée et que les décès continuent, même dans une proportion plus élevée que les décès dus à la grippe ». Au cours de la dernière période de 28 jours rapportée par l'OMS, 2 300 personnes sont mortes du COVID dans le monde.
« Ces nouvelles sous-lignées ont le potentiel d'évoluer vers une nouvelle variante qui est un avant et un après en termes de mémoire immunologique. Il pourrait non seulement échapper aux anticorps mais aussi à la réponse mémoire des lymphocytes T. Cette dernière réponse est celle qui assure la protection contre les conditions sévères », a-t-il souligné. "Par conséquent, il serait inquiétant que le virus parvienne à échapper efficacement à la réponse T. C'est très difficile à prévoir", a-t-il ajouté.
Comme mesures, Geffner a insisté sur le renforcement de la surveillance génomique du coronavirus. « Il n'est pas nécessaire d'abandonner le suivi des sous-variantes qui circulent. Bien que les cas graves et la mortalité aient diminué par rapport aux années précédentes, grâce à la vaccination, aujourd'hui, à ce stade de la pandémie, des tests devraient être effectués dans certaines institutions hospitalières importantes pour savoir quel pourcentage de cas respiratoires sont dus au coronavirus », dit Geffner.
De plus, a-t-il conseillé, « il faudrait faire plus de surveillance des eaux usées dans les communautés, pour suivre le coronavirus, qui nous a déjà réservé de mauvaises surprises. Le coronavirus doit continuer à être étudié rigoureusement à travers le monde.
Pendant ce temps, le Dr Humberto Debat , de l' Institut national de technologie agricole (INTA) et Proyecto País, du ministère de la Science, de la Technologie et de l'Innovation , a estimé qu'actuellement le groupe d'experts sur l'évolution du virus de l'OMS prend en compte les sous-lignées de Ómicron en termes de trois facteurs. Actuellement, on parle d'une variante de surveillance et d'une variante d'intérêt.
Quant à la détection de la sous-lignée BA.2.86, "elle est très pertinente", a déclaré Debat. « Il a 58 mutations supplémentaires dans la protéine Spike du virus original de Wuhan, en Chine. Il est dérivé de la sous-lignée BA.2. Certaines de ces mutations conféreraient une plus grande évasion immunitaire que d'autres versions du virus. Mais a priori il n'est pas possible de savoir s'il est plus transmissible. Il y a un remue-ménage dans la communauté évolutionniste. Nous verrons quels seront les résultats des prochaines études », a-t-il déclaré.
Les risques de la sous-ligne BA.2.86 sont que «ses mutations lui confèrent un avantage de transmission en raison de sa capacité à échapper à l'immunité, ce qui entraîne davantage de cas de personnes atteintes de COVID-19. Il existe également un risque que cette sous-lignée diffère suffisamment des vaccins de rappel pour compromettre leur efficacité », a déclaré le Dr Amesh Adalja , chercheur principal au Center for Health Security et professeur auxiliaire à l' École, dans un dialogue avec Infobae . Bloomberg Professor of Santé publique à l'Université Johns Hopkins aux États-Unis .
Pour Adelja, la population devrait prendre en compte la vaccination avec rappel : « De nouvelles variantes vont continuer à apparaître car c'est un virus endémique qui ne sera pas éradiqué. La chose fondamentale aujourd'hui est de se rappeler que les variantes peuvent provoquer une infection, mais qu'elles ne peuvent pas perturber gravement la société, en raison de l'immunité de la population, ainsi que de la disponibilité de la thérapie antivirale ».
Pour le moment, en termes de vaccins, la société Moderna a signalé que son vaccin COVID 2023 mis à jour montrait une augmentation significative des anticorps neutralisants contre les variantes EG.5 et FL.1.5.1. Les résultats des études sur la sous-lignée BA.2.86 n'ont pas encore été diffusés.
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