Omicron sous la loupe : radiographie de la variante qui dominait le monde il y a un an et échappait à l'immunité

Les variantes BQ.1, BQ.1.1 et BA.2.75.2 sont résistantes à l'immunité et à l'infection induites par le vaccin (Getty)

Il était une fois une nouvelle variante du SRAS-CoV-2 détectée en Afrique du Sud en novembre 2021. C'est ainsi que pourrait commencer l'histoire, qui a Ómicron comme protagoniste. Mais, contrairement à ses sœurs aînées, qui en plus ou moins de temps avaient été remplacées par une autre mutation, cette variante du coronavirus allait longtemps dominer le monde. Je pourrais continuer l'histoire.

Et il y a plus : avec une contagiosité élevée et un pouvoir jamais vu auparavant pour échapper à la réponse immunitaire , Ómicron n'a pas hésité à défier les sociétés pharmaceutiques de développer de nouveaux vaccins de deuxième génération pour tenter de contenir leur avance.

Pour le moment, il n'y a pas de "heureux pour toujours" pour cette histoire. C'est que, un peu plus d'un an après son émergence, Ómicron continue de donner naissance à de nouvelles sous-lignées qui tiennent en haleine la communauté scientifique internationale.

Le SRAS-CoV-2 a évolué pour supprimer l'immunité innée de ses hôtes (Getty)

C'est que malgré le pourcentage élevé de la population vaccinée dans le monde, les spécialistes ont commencé à voir depuis Ómicron que le virus parvenait à échapper aux anticorps contre le COVID-19, à la fois ceux générés par les formulations développées en un temps record et l'immunité naturelle de ceux qui avait contracté la maladie.

Ainsi, dans l'ordre de l'alphabet grec que l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a commencé à attribuer aux variantes émergentes de coronavirus préoccupantes, Ómicron était la 13e variante nommée en moins d'un an. Et maintenant, il règne depuis un an et presque un mois.

Les premières sous-variantes de la dernière ? une variante

Le 9 novembre 2021, le premier cas de cette mutation a été détecté et en quelques mois il a dominé la planète avec une version plus contagieuse du virus (Reuters)

De l'OMS, ils soutiennent que "Omicron ne sera probablement pas la dernière variante du SRAS-CoV-2". "On ne sait pas encore, mais plus le virus circule, plus il y a de chances qu'une nouvelle variante plus mortelle qu'Ómicron émerge", disent-ils.

Les experts conviennent que la possibilité que de nouvelles mutations apparaissent par recombinaison de variantes précédentes existe toujours.

De l'avis du médecin infectiologue Pablo Bonvehí, "la variante Ómicron n'a pas été remplacée car, comme une grande partie de la population a déjà été vaccinée , cela rend plus difficile la progression du virus et peut générer des changements si importants qu'ils générer une autre variante différente." ”. "Ces changements sont mineurs en raison de l'immunité de la population, sûrement, due aux vaccins et à ceux qui ont déjà été infectés", a-t-il observé avant la consultation Infobae.

À quoi l'immunologiste et chercheur au CONICET Jorge Geffner a ajouté : "La vérité est que la combinaison de mutations qu'Ómicron a dans ses différentes lignées (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 et BA.5) et dans les nouvelles sous-lignées qui ont des noms rares et qui ont été récemment caractérisées, elles lui confèrent cette énorme transmissibilité et il ne devrait évidemment pas être facile pour le SRAS-CoV-2 de faire correspondre un ensemble de mutations qui lui confèrent une transmissibilité encore plus grande. Je pense que c'est pourquoi, au fond, jusqu'à présent, Ómicron n'a pas été remplacé par un autre, comme c'était le cas avec les précédents. Omicron est hautement transmissible et possède ce côté supplémentaire qui lui donne la capacité d'échapper à la réponse immunitaire."

Après l'évolution de la variante originale, ses descendants se sont divisés en au moins cinq branches, appelées BA.1 à BA.5, qui se sont progressivement remplacées dans le domaine des nouvelles infections. À ce stade, BA.2.75.2 était l'un des "petits-enfants" Omicron les plus insaisissables de l'immunité.

La sélection naturelle, le secret de sa plus grande transmissibilité

Il est dans la nature du virus de muter pour échapper aux anticorps et se reproduire (Getty)

La question que les chercheurs continuent de se poser à ce stade est de savoir ce qui motive l'évolution des sous-lignées Ómicron ? La réponse à cela, selon le virologue et professeur de maladies infectieuses émergentes à Penn State, Suresh V. Kuchipudi, "est un processus bien connu appelé sélection naturelle".

"La sélection naturelle est un processus évolutif dans lequel les traits qui confèrent à une espèce un avantage reproductif continuent d'être transmis à la génération suivante, tandis que les traits qui ne le sont pas sont éliminés par la concurrence", a-t-il expliqué. Alors que le SRAS-CoV-2 continue de circuler, la sélection naturelle favorisera les mutations qui donnent au virus le plus grand avantage de survie . »

Plusieurs mécanismes contribuent à la transmissibilité accrue des variants du SARS-CoV-2. L'un est la capacité de se lier plus fortement au récepteur ACE2, une protéine du corps qui aide principalement à réguler la pression artérielle, mais qui aide également le SRAS-CoV-2 à pénétrer dans les cellules du corps. Les sous-lignées Omicron ont des mutations qui les rendent plus aptes à échapper à la protection des anticorps tout en conservant leur capacité à se lier efficacement aux récepteurs ACE2. La sous- lignée BA.5 , par exemple, s'est avérée capable d'échapper aux anticorps de la vaccination et de l'infection précédente.

En plus de ces mutations d'évasion immunitaire, le SRAS-CoV-2 a évolué pour supprimer l'immunité innée de ses hôtes, dans ce cas, les humains. L'immunité innée est la première ligne de défense du corps contre les agents pathogènes envahisseurs, composée de protéines antivirales qui aident à combattre les virus. Le SRAS-CoV-2 a la capacité de supprimer l'activation de certaines de ces protéines antivirales clés, ce qui signifie qu'il peut vaincre efficacement de nombreuses défenses de l'organisme. Ceci explique la propagation des infections entre personnes vaccinées ou précédemment infectées.

Que sait-on des nouveaux BQ.1, BQ.1.1, BA.2.75.2 et XBB

Les infections avec ces sous-lignées représentent déjà près de la moitié de celles enregistrées par COVID-19 aux États-Unis (Getty)

Dans son dernier rapport de surveillance génomique sur les variantes circulantes du COVID-19, les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ont indiqué que les sous-variantes BQ.1 et BQ.1.1 d'Ómicron représentaient près de la moitié des cas de coronavirus dans le pays au cours de la semaine se terminant le 19 novembre, comparativement à 39,5 % la semaine précédente.

Les nouvelles sous-variantes BQ.1 et BQ.1.1 d'Ómicron ont également été détectées dans cinq pays de l'Union européenne. Et comme l'a rapporté l'OMS elle-même, la sous-variante BQ.1 augmente également dans le monde, avec une croissance de 13% des cas à 16% la semaine dernière.

BA.5, quant à lui, est passé de dominant à ne représentant qu'une partie minime des nouvelles infections.

Selon les National Institutes of Health des États-Unis, les sous- variantes de BQ sont plus immunisées contre l'évasion et probablement résistantes aux principaux anticorps, tels que ceux utilisés par les personnes dont le système immunitaire est affaibli.

Les nouvelles sous-lignées d'Omicron, BQ.1 et BQ.1.1, sont les souches que les scientifiques surveillent de plus près depuis fin septembre (Getty)

BQ.1 est une sous-lignée de BA.5, portant des mutations de pointe sur certains sites antigéniques clés, notamment K444T et N460K. En plus de ces mutations, la sous- lignée BQ.1.1 - familièrement appelée le chien de l'enfer - porte une mutation de pointe supplémentaire sur un site antigénique clé (c'est-à-dire R346T).

Bien qu'il n'y ait pas de données sur la gravité ou l'évasion immunitaire des études sur l'homme, BQ.1 montre un avantage de croissance significatif par rapport aux autres sous-lignées Omicron en circulation.

Alors que XBB est un recombinant des sous-lignées BA.2.10.1 et BA.2.75. Il a commencé à circuler début octobre à Singapour et en Inde et s'est rapidement répandu dans 35 pays.

Bien que d'autres études soient nécessaires, selon l'OMS, les données actuelles ne suggèrent pas qu'il existe des différences substantielles dans la gravité de la maladie pour les infections à XBB. Cependant, il existe des preuves préliminaires indiquant un risque plus élevé de réinfection, par rapport aux autres sous-lignées Ómicron en circulation.

Le nom

Les nouvelles sous-lignées Ómicron sont présentes en Argentine depuis octobre, mais l'information n'a été publiée que cette semaine lorsque les données du dernier Bulletin épidémiologique national, correspondant à la semaine épidémiologique numéro 46 ou SE46 (du 13 au 19 novembre), ont été publiées.

Le texte officiel précise : "Dans SE41, 1 cas d'Ómicron BQ.1.1 et 1 cas d'Ómicron XBB.116 ont été enregistrés." En d'autres termes, ces deux sous-variantes préoccupantes circulaient déjà en Argentine depuis 5 semaines, mais elles n'étaient pas apparues dans les précédents Bulletins épidémiologiques d'octobre et de novembre ou, plus précisément, du 9 au 15 octobre, soit la semaine 41. .

Dans ce contexte, mercredi dernier, le ministère de la Santé de la Nation a précisé que les messages devenus viraux sur WhatsApp avertissant du danger et de sa supposée plus grande létalité de la nouvelle variante d'Ómicron XBB étaient faux.

Consulté à ce sujet par Infobae, le médecin spécialiste des maladies infectieuses Roberto Debbag (MN 60253) a déclaré : "Nous avons observé l'augmentation de la variante BQ.1.1 ces dernières semaines, comme l'un des SARS-CoV-2 les plus immuns et les plus évasifs vus ainsi". loin ». "Contrairement aux autres sous-lignées analysées, BQ.1.1 montre une résistance à tous les anticorps monoclonaux disponibles, et cela renforce certainement les propriétés d'évasion immunitaire de cette variante", analyse le spécialiste. De toute évidence, en ce sens, BQ.1.1 est une variante plus inquiétante que BQ.1, il est donc essentiel de surveiller son évolution dans les semaines à venir."

Geffner :

La bonne nouvelle, pour lui, c'est que "c'est la première fois dans la pandémie qu'une variante avec une évasion immunitaire aussi marquée et nette ne produit pas une nouvelle vague pandémique majeure". Des exemples de variantes précédentes qui ont déclenché des pics d'infections sont Beta, Gamma, Ómicron BA.1, BA.2 et BA.5. "Chacune de ces variantes a conduit à de grandes vagues à l'échelle mondiale ou sur des continents spécifiques, comme l'a fait Beta en Afrique du Sud ou Gamma en Amérique du Sud", a déclaré Debbag, pour qui "il faut s'attendre à ce qu'en raison d'infections antérieures, de vaccins, de renforts et de combinaisons de ces facteurs, le virus a de plus en plus de mal à trouver de nouveaux hôtes.

Pour cela, a-t-il estimé, "il est essentiel d'augmenter l'application des troisième et quatrième doses de rappel dans le pays, car, comme on le voit, ce sont les vaccins qui offriront la meilleure protection contre ces nouveaux et toutes les sous-variantes qui peuvent survenir ."

La fin de la pandémie est-elle proche ?

Pour Topol, il sera essentiel que les vaccins nasaux soient développés comme renfort pour l'avenir (Getty)

Dans une publication récente, le célèbre scientifique Eric Topol, directeur de l'Institute for Translational Research en Californie, aux États-Unis, a fait valoir qu'"il serait tentant d'interpréter l'absence d'impact de BQ.1.1, par rapport à ses propriétés d'évasion immunitaire, comme un signe que le monde est déjà hors de danger face au COVID-19″.

“Se ha construido un muro de inmunidad a nivel de población durante tres años, con todas las infecciones y vacunas”, reconoció el experto, quien sin embargo destacó que “la tasa de mutación del SARS-CoV-2 ha aumentado un 30% en le dernier an". "Il pourrait encore y avoir de la place au sein d'Omicron, et en particulier des recombinants XBB, pour constituer une menace importante", a-t-il déclaré. De plus, il y a la sombre perspective d'une toute nouvelle famille de variantes émergeant de la cascade de mutations que nous avons observées chez Omicron depuis plus d'un an."

Selon son point de vue, "il y a la possibilité de nouveaux moments difficiles". "C'est pourquoi il est encore essentiel de développer des moyens d'obtenir une immunité muqueuse grâce à des vaccins nasaux pour bloquer les infections et de s'appuyer sur tous les travaux qui ont conduit à de nombreux pan-sarbecovirus et pan-bêta-coronavirus, des anticorps neutralisants qui sont des modèles de vaccin- des vaccins à l'épreuve », a-t-il conclu.

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