Les chauves -souris, seuls mammifères capables de voler, sont dans le collimateur de l'humanité suite aux urgences de santé publique qui ont frappé le monde au cours des deux dernières décennies. Car certaines des 1 400 espèces de chauves-souris pourraient être des réservoirs naturels de virus à potentiel pandémique.
Trois études scientifiques ont révélé quels sont certains des coronavirus qui infectent les espèces de chauves-souris qui habitent l'Argentine. Pour le moment, la présence de "bétacoronavirus" n'a pas été détectée dans le pays, qui est précisément le genre de coronavirus qui a donné lieu à des pandémies. Le SRAS-Cov-2 qui cause la maladie COVID-19 est un bêtacoronavirus.
Les travaux menés ont permis de détecter un autre type de coronavirus qui jusqu'à présent n'avait pas généré d'épidémies ou de pandémies touchant l'être humain. Ils ont découvert la présence d'alphacoronavirus. De même, les chercheurs pensent que ces résultats n'impliquent pas que la surveillance des virus dans la faune sauvage doive être relâchée.
Les résultats des trois travaux permettront de développer une telle surveillance des agents pathogènes. Parce que la faune peut être en contact avec les humains. Ses agents pathogènes peuvent sauter à d'autres espèces. Les études rendent également visible l'importance de protéger les chauves-souris afin qu'elles puissent rester dans leurs habitats sans être dérangées par l'avancée humaine.
L'une des enquêtes a été publiée la semaine dernière dans le magazine spécialisé Archives of Virology . Il était dirigé par les scientifiques Carolina Torres et Ana Bratanich, de l'Université de Buenos Aires et de Conicet.
"Nous voulions avoir une radiographie de la présence de coronavirus dans le pays", a déclaré le Dr Bratanich à Infobae . Ils ont obtenu 457 échantillons de chauves-souris et de rongeurs du Nord et du Centre.
Des échantillons ont été prélevés en 2020 et 2021 dans la région des Yungas dans la province de Jujuy et dans la région nord-est de la province de La Pampa. Des bâtiments délabrés, des mines de fer abandonnées et des hangars de stockage de céréales dans les zones rurales ou à la périphérie des villes où se trouvaient des nids de différentes espèces de chauves-souris ont été choisis pour l'échantillonnage.
Lors de l'analyse des échantillons, des séquences d'alphacoronavirus ont été détectées dans trois groupes de chauves-souris . "Nous n'avons pas détecté de bêtacoronavirus chez les chauves-souris étudiées", a noté Bratanich. Mais comme il s'agissait d'un nombre limité d'échantillons et de lieux évalués, il a reconnu que la présence de bétacoronavirus dans le pays ne peut être exclue.
L'équipe scientifique a également révélé que l'analyse phylogénétique a montré des relations entre les virus de chauve-souris en Argentine et les alphacoronavirus trouvés au Brésil.
Pendant ce temps, une autre enquête sur les chauves-souris et les coronavirus a été menée dans la province de Santa Fe. Ils ont bénéficié d'une subvention de l'Agence nationale pour la promotion de la recherche, du développement technologique et de l'innovation.
La scientifique Adriana Giri, directrice du laboratoire de virologie humaine de l'IBR du Conicet à Rosario et ses collaborateurs ont présenté les résultats en décembre dernier lors de la Conférence de la Société argentine de virologie.
« Depuis plusieurs années, nous étudions la présence de virus chez les chauves-souris. En 2017, nous avions caractérisé les virus à ADN chez ces animaux. En 2019, avant le début de la pandémie de COVID-19, nous avions commencé à rechercher des virus à ARN chez les chauves-souris", a rappelé Giri, en dialogue avec Infobae .
Ils ont prélevé des échantillons d'excréments de chauves-souris sur trois sites à Santa Fe. L'un des sites est la faculté de droit de l'Université nationale de Rosario (UNR), située dans le macrocentre de la ville de Rosario.
Le deuxième site d'échantillonnage est situé dans une ville à la périphérie de Rosario, Zavalla. Le troisième est la réserve écologique de l'Universidad Nacional del Litoral.
« Jusqu'à présent, nous avons pu identifier et caractériser le génome de trois coronavirus différents chez les chauves-souris de la colonie de la faculté de droit de l'UNR. Ils appartiennent tous au genre Alphacoronavirus, qui sont liés au rhume", a-t-il expliqué. Des génomes viraux complets ont été obtenus à l'aide d'approches métagénomiques reposant sur un séquençage approfondi et une analyse bioinformatique.
Sur le site de la Faculté de droit de l'Université nationale de Rosario, les chauves-souris qui ont été identifiées avec des coronavirus sont migratrices. Ce sont des chauves-souris femelles qui viennent sur place pour mettre bas au printemps et repartent à la fin de l'été.
« L'étude est toujours en cours. Parce qu'il sert à avoir une image des virus que les chauves-souris de notre région abritent comme réservoirs naturels. De cette façon, la surveillance contribue à être conscient de la possibilité qu'il existe des virus qui peuvent provoquer des épidémies chez l'homme », a commenté Giri.
Bien qu'il ait souligné : « Il n'y a pas lieu de s'alarmer des virus présents chez les chauves-souris. Dans certains cas, comme le quartier de Rosario, ils sont proches des personnes mais ne constituent pas une menace pour la santé publique. Il suffit de le découvrir", a-t-il déclaré.
Le groupe de chercheurs de l'Institut d'écologie, de génétique et d'évolution, Conicet et UBA et de l'Institut ANLIS/Malbrán n'a pas non plus trouvé de bétacoronavirus dans une étude sur des échantillons de chauves-souris de 6 juridictions : la ville de Buenos Aires et les provinces de Buenos Aires, Río Negro, Neuquén, La Pampa et Chubut.
Les travaux ont été publiés dans la revue Microbiology Spectrum de l'American Society for Microbiology. Le premier auteur, Diego Caraballo, a déclaré à Infobae que des échantillons ont été analysés à partir de chauves-souris qui arrivent dans les zones zoonotiques des 6 juridictions.
"Nous avons découvert que deux lignées différentes d'alphacoronavirus co-circulent entre les chauves-souris Molossus (ce qui est très courant dans les villes) et Tadarida ", a déclaré le biologiste. "Nous avons également détecté qu'il y avait un saut d'alphacoronavirus entre eux", a-t-il ajouté.
Ils ont également signalé que le genre de chauve-souris Myotis fonctionnerait comme un réservoir pour la diversité des coronavirus et en tant que tel est un hôte clé. "Avoir ces nouvelles connaissances permet à l'Argentine de savoir quels virus se trouvent chez les chauves-souris et fait partie de la préparation au risque de futures pandémies", a déclaré Caraballo.
En Argentine, il existe 68 espèces de chauves-souris décrites. En Amérique latine, il y aurait environ 400 espèces, et on estime qu'il y a encore plus de virus à découvrir chez les chauves-souris.
« La surveillance des virus chez les chauves-souris est un outil clé pour la prévention et la détection précoce des agents pathogènes capables de générer des épidémies. Ce sont des études interdisciplinaires du paradigme One Health, qui relie la santé animale et humaine », a déclaré à Infobae Humberto Debat, chercheur en virologie à l'Institut national de technologie agricole (INTA) et membre de Proyecto País, le consortium de surveillance génomique des coronavirus. le Ministère de la Science, de la Technologie et de l'Innovation de la Nation.
"Pour le moment, seule la présence d'alphacoronavirus a été confirmée chez les chauves-souris. À l'avenir, des études plus complètes du génome des virus pourraient être menées sur l'ensemble du territoire pour renforcer la surveillance des zoonoses », a commenté Debat.
Les chauves-souris sont des réservoirs naturels de divers virus. Ils ne tombent généralement pas malades. Leur système immunitaire les protège, même s'ils peuvent tomber malades lorsqu'ils attrapent le virus de la rage.
Au-delà du fait qu'elles peuvent être des réservoirs de virus, les chauves-souris sont nécessaires dans leurs écosystèmes aux autres êtres vivants qui peuplent la planète. Par exemple, ils luttent contre les ravageurs en mangeant des insectes nuisibles aux cultures ou à la santé humaine, ou ils pollinisent des plantes commercialement importantes.
Bien que les bétacoronavirus dérivés des chauves-souris soient impliqués dans les dernières urgences de santé publique telles que le COVID-19, la recherche scientifique pointe aujourd'hui la responsabilité des activités humaines qui favorisent les sauts de virus entre les espèces.
Raina Plowright, écologiste des maladies à l'Université Cornell aux États-Unis et co-auteur d'un article récent dans la revue Nature , a noté que la pression exercée sur les chauves-souris par le changement climatique et l'empiètement du développement humain ont augmenté la fréquence des chauves-souris. sautent des chauves-souris aux humains et provoquent des maladies zoonotiques.
"Les sauts de virus entre les espèces sont le résultat d'une cascade de facteurs de stress : l'habitat des chauves-souris se dégage, le temps devient plus extrême et les chauves-souris se déplacent vers les zones habitées à la recherche de nourriture", a expliqué Plowright.
De par leur importance écologique, les chauves-souris ne doivent pas être stigmatisées : elles sont nécessaires et ne portent pas malheur comme le dit un mythe qui circule encore.
"Les chauves-souris ne pénètrent généralement pas dans les espaces clos des humains. C'est l'inverse : les humains pénètrent dans les espaces des chauves-souris », a expliqué le Dr Giri.
Si une personne trouve une chauve-souris blessée, elle ne doit ni la toucher ni la tuer, a-t-il recommandé. Si vous entrez dans une maison, vous devez appeler l'autorité locale appropriée.
"Les chauves-souris jouent un rôle dans le maintien des fonctions vitales des écosystèmes", a déclaré le scientifique de Rosario. Mais ils ont toujours mauvaise presse malheureusement."
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