Ils découvrent la clé pour combattre toutes les variantes de COVID-19

Les scientifiques commencent à découvrir les raisons de l'infectiosité du SARS-CoV-2 (Getty)

Les résultats, publiés dans Nature Communications , utilisent la cryo-microscopie électronique (cryo-EM) pour révéler la structure au niveau atomique de la tache vulnérable sur la protéine de pointe du virus, connue sous le nom d'épitope. Le document décrit en outre un fragment d'anticorps, appelé VH Ab6, qui peut se lier à ce site et neutraliser chaque variant majeur.

Une nouvelle technologie appliquée par des chercheurs permet aux scientifiques de congeler rapidement des protéines au niveau atomique

"Il s'agit d'un virus hautement adaptable qui a évolué pour échapper à la plupart des traitements par anticorps existants , ainsi qu'à une grande partie de l'immunité conférée par les vaccins et les infections naturelles." , a déclaré Sriram Subramaniam , professeur à l'École de médecine de l'UBC et auteur principal de l'étude. « Cette recherche révèle un point faible qui change à peine entre les variantes et peut être neutralisé par un fragment d'anticorps. Ainsi, le décor est planté pour la conception de traitements pan-variants qui pourraient aider de nombreuses personnes vulnérables », a-t-il ajouté.

La nouvelle technologie appliquée par les chercheurs permet aux scientifiques de congeler rapidement les protéines au niveau atomique afin qu'ils puissent prendre des centaines de milliers d'instantanés - tout comme les rayons X - de protéines individuelles. "Nous pouvons ensuite les combiner par calcul en 3D pour créer le paysage atomique de ce à quoi ressemble la protéine", a déclaré Subramaniam.

Le scénario variable, désormais maîtrisé

Cette clé s'est avérée efficace contre les variantes Alpha, Beta, Gamma, Delta, Kappa, Epsilon et Omicron.

Cette clé parfaite mentionnée par Subramaniam a été identifiée dans ce nouvel article. Il s'agit du fragment d'anticorps VH Ab6, qui s'est avéré efficace contre les variants Alpha, Beta, Gamma, Delta, Kappa, Epsilon et Omicron . Le fragment neutralise le SRAS-CoV-2 en se liant à l'épitope sur la protéine de pointe et en bloquant l'entrée du virus dans les cellules humaines .

La découverte est la dernière d'une collaboration de longue date et productive entre l'équipe de Subramaniam à l'UBC et ses collègues de l'Université de Pittsburgh, dirigée par Mitko Dimitrov et Wei Li. L'équipe de Pittsburgh a criblé de grandes bibliothèques d'anticorps et testé leur efficacité contre le COVID-19, tandis que l'équipe de l'UBC a utilisé la cryo-EM pour étudier la structure moléculaire et les caractéristiques de la protéine de pointe.

Le groupe de réflexion Columbia est mondialement reconnu pour son expertise dans l'utilisation de cette technologie pour visualiser les interactions protéine-protéine et protéine-anticorps à résolution atomique.

Le fragment neutralise le SRAS-CoV-2 en se liant à l'épitope de la protéine de pointe et en empêchant le virus de pénétrer dans les cellules humaines, ont expliqué les scientifiques.

Comment toutes les variantes du SRAS-CoV-2 pourraient être combattues

Dans un autre article publié plus tôt cette année dans Science , ces experts ont été les premiers à signaler la structure de l'interface entre la protéine de pointe d'Omicron et le récepteur cellulaire humain ACE2, fournissant une explication moléculaire de l' amélioration de l'aptitude virale d'Omicron.

« Cette vulnérabilité clé peut être exploitée par les fabricants de médicaments, et comme le site est relativement exempt de mutations, les traitements qui en résultent pourraient être efficaces contre les variantes existantes et même futures. Nous avons une image très claire de ce point vulnérable du virus : nous connaissons toutes les interactions que la protéine de pointe fait avec l'anticorps à ce site », a souligné Subramaniam.

En ce sens, le spécialiste a prédit comment ces avancées pourraient être utilisées. «Nous pouvons travailler à rebours à partir de cela. Comment? Utiliser une conception intelligente pour développer un grand nombre de traitements par anticorps largement efficaces et résistants aux variantes. Cela changerait la donne dans la lutte en cours contre le COVID-19. ″.

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