C'est le cas de la nouvelle lignée Omicron, baptisée BA.2.75 et identifiée en Inde il y a quelques semaines. Dans ce pays, les infections au COVID-19 augmentent rapidement, bien que les taux d'hospitalisation soient jusqu'à présent faibles.
Alors que les pays attendent la fin des vagues de COVID-19 causées par la variante BA.5, les chercheurs gardent un œil sur ce qui va suivre, avertissant que cette variante indienne également appelée Centarurus pourrait provoquer une nouvelle explosion d'infections. Ce qui est certain à ce jour, c'est que BA.2.75 a été détecté dans plus de 20 pays à travers le monde , et les chercheurs espèrent savoir s'il augmentera considérablement le nombre de cas après une vague d'infections à BA.5.
Un grand nombre d'études suggèrent que les deux variantes ont des capacités à peu près similaires pour échapper à l'immunité conférée par l'infection et la vaccination. Cela suggère que «Centaurus» pourrait ne pas entraîner de cas beaucoup plus loin en dehors de l'Inde, du moins pas tant que l'immunité de la population est élevée et avant que la variante n'acquière de nombreuses mutations supplémentaires. La surveillance des variantes du SRAS-CoV-2 passe entre les mailles du filet dans de nombreux pays, mais l'Inde semble être à l'épicentre de la propagation du BA.2.75. Cette lignée chargée de mutations a évolué à partir de la sous-variante BA.2 d'Omicron, qui s'est généralisée au début de 2022.
Des chercheurs indiens ont séquencé plus de 1 000 échantillons de la variante depuis mai. . “Los datos sugieren que alrededor de dos tercios de los casos nuevos actualmente son causados por BA.2.75″, explicó Shahid Jameel, virólogo de la Universidad de Oxford, Reino Unido, quien anteriormente dirigió el consorcio de secuenciación del SARS-CoV-2 de L'Inde. La variante semble avoir un avantage de transmission "assez considérable" sur BA.5 en Inde, a déclaré le Dr Tom Wenseleers, biologiste de l'évolution à l'Université catholique de Louvain en Belgique, qui a modélisé son ascension.
" Cela provoquerait certainement une vague d'infection ", dit-il. Le nombre d'infections confirmées, une petite partie du nombre réel probable, a augmenté dans toute l'Inde, note Wenseleers, tout comme le pourcentage de tests qui reviennent positifs (une mesure plus fiable lorsque les taux de test sont faibles).
Jusqu'à présent, BA.2.75 a été détecté à des taux relativement faibles en dehors de l'Inde, dans des pays comme le Japon, les États-Unis et le Royaume-Uni, qui se situent au milieu ou juste après les pics de pics causés principalement par BA.5 . . En conséquence, Jameel ne s'attend pas à ce que BA.2.75 déclenche de grosses vagues dans la plupart des endroits. "Nous arrivons à un point où ces variantes se font concurrence et sont presque équivalentes", dit-il. "Je pense que les personnes qui ont eu BA.5 n'auront pas d'infections percées avec BA.2.75, et vice versa."
Des études de laboratoire publiées sur des serveurs de préimpression ces dernières semaines et rapportées dans Nature accréditent cette idée. Plusieurs équipes ont découvert que les deux variantes ont une capacité similaire à échapper aux anticorps provoqués par la vaccination et une infection antérieure , BA.5 montrant un léger avantage sur son lointain cousin. Cela rend la montée du BA.2.75 en Inde, où le BA.5 est également présent, assez déroutante, déclare Yunlong Richard Cao, immunologiste à l'Université de Pékin à Pékin, qui a codirigé l'une des études.
Son équipe pense que le profil d'immunité de l'Inde fait partie de l'explication. En 2021, le pays a connu une vague explosive de cas causés par la variante Delta , qui partage une mutation clé avec BA.5. Cao soupçonne que les infections précédentes de Delta offrent une protection supplémentaire contre BA.5, laissant une opportunité pour BA.2.75. Cao et son équipe ont découvert que plusieurs personnes qui avaient eu des infections à Delta après la vaccination produisaient des anticorps plus puissants contre BA.5 que BA.2.75. "Je suppose que BA.2.75 ne sera probablement pas aussi répandu en dehors de l'Inde", en particulier dans les pays qui n'ont pas été fortement touchés par Delta, ajoute Cao.
D'autres chercheurs disent que le petit nombre d'infections Delta après la vaccination dans l'étude de Cao et ses collègues signifie que l'hypothèse doit être traitée avec prudence. En outre, Wenseleers a trouvé des signes provisoires que B.2.75 pourrait se propager légèrement plus rapidement que BA.5 dans certains pays, dont l'Australie, le Royaume-Uni, les États-Unis et le Canada. Et il prédit que BA.2.75 continuera de croître à l'échelle mondiale, en particulier en Asie et en Océanie. Mais il y a aussi des signes qu'une autre sous-lignée Omicron poussant en Europe et en Amérique du Nord, appelée BA.4.6, est tout aussi transmissible que BA.2.75. "Nous pourrions nous retrouver avec un mélange éclectique de descendants d'Omicron, différents descendants devenant dominants dans différentes parties du monde", déclare Wenseleers.
Pas d'augmentation des hospitalisations
Jusqu'à présent, l'Inde ne connaît pas d'augmentation significative des hospitalisations de sa vague «Centaurus». Jameel attribue les effets combinés des taux de vaccination élevés et des infections antérieures : "Cette immunité hybride protégera grandement et empêchera les gens d'aller dans les hôpitaux."
Wenseleers et d'autres s'attendent à ce que le même schéma se répète ailleurs, que la prochaine variante soit BA.2.75 ou autre chose entièrement. " L'immunité de plus en plus élevée de la population entraîne des conséquences de moins en moins graves pour la plupart des gens ", dit-il.
Si BA.2.75 ne se propage pas largement maintenant, il pourrait le faire d'ici plusieurs mois, car il capte de nouvelles mutations qui échappent au système immunitaire et la protection causée par l'infection BA.5 diminue, dit Cao. Certaines séquences BA.2.75 incluent une mutation trouvée dans BA.5, appelée L452R, qui pourrait augmenter la capacité de la variante à réinfecter les gens, ajoute-t-il. "C'est ce qui le rend effrayant."
Même si les taux d'hospitalisation et de mortalité restent faibles dans une vague causée par Centaurus ou quoi que ce soit d'autre, disent les chercheurs, la fréquence élevée des vagues d'infection pourrait signifier un COVID plus long et une perturbation générale causée par des niveaux élevés de maladie «La prochaine chose que nous devons faire est de réduire les volumes d'infection. En fin de compte, c'est le problème », a conclu Wenseleers.
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