Delta a secoué le monde. C'était la variante la plus meurtrière de COVID et a alarmé l'humanité. Alors que les lettres de l'alphabet grec traversaient la planète entre les mains du SRAS-CoV-2, l'incertitude était la règle au milieu de 2021. Chaque mutation semblait déterminée à ruiner les tables de Noël de millions de personnes.
Bien qu'elle ait parcouru un long chemin depuis décembre 2019, avec le premier cas caractérisé à la fin de cette année (bien que de nouvelles découvertes d'infections antérieures aient suivi), les populations n'étaient plus surprises, bien qu'elles soient attentives aux caractéristiques de ce dernier. .lettre qui a su montrer ce virus qui aujourd'hui est en passe de devenir endémique.
Lorsque le premier cas d' Omicron est finalement arrivé, qui pour l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a eu lieu le 9 novembre 2021, les scientifiques et les experts ont averti que ses plus de 25 mutations en faisaient une sorte de nouveau virus. Que seule sa présence marquerait un avant et un après dans cette histoire qui est actuellement sur le point d'avoir trois ans.
C'est que cette variante plus "anodine", mais beaucoup plus contagieuse, a fait que ceux qui n'avaient pas été infectés par le COVID-19 jusqu'à présent, s'interrogent au moins sur sa présence dans une maison. De plus, ceux qui se considéraient comme immunisés parce qu'ils avaient traversé l'infection et avaient été vaccinés, retombaient entre les mains d'Omicron. Encore une fois, les infections se sont produites entre quatre murs et ceux qui avaient déjà eu le virus (face à une réinfection) n'ont pas voulu ruiner ceux qui étaient encore indemnes.
Infobae s'est entretenu avec l'immunologiste et chercheur du CONICET Jorge Geffner ; le docteur en physique, chercheur à Conicet et secrétaire de Planification à l'Université nationale de Hurlingham, Jorge Aliaga ; la chercheuse à l'Institut de recherche biomédicale sur les rétrovirus et le sida (UBA) et au CONICET, Mirna Biglione ; et le chef de l'infectiologie au CEMIC et ancien président de la Société argentine des maladies infectieuses, Pablo Bonvehí ; sur cette variante qui (pour le moment) reste prédominante sur la planète.
9 novembre : le jour qui a changé la pandémie
Lorsque Delta était la variante à vaincre par la science, comme s'il s'agissait d'un tourbillon, Omicron a fait son apparition. Le premier cas a été signalé le 9 novembre 2021, bien que le premier isolement ait été signalé 48 heures plus tard, le 11 novembre, au Botswana. Son expansion a été fulgurante : le 14 novembre, il est apparu en Afrique du Sud et de là, il a réussi à se répandre sur toute la Terre.
Compte tenu de son comportement, "le 26 novembre 2021, sur la base des orientations fournies par le groupe consultatif technique de l'OMS sur l'évolution du virus, l'OMS a classé la variante B.1.1.529 comme variante préoccupante et lui a donné le nom de 'Ómicron'", selon un communiqué de l'OMS. Ils ont également souligné que cette mutation "est très divergente, puisqu'elle présente entre 26 et 32 mutations dans la protéine de pointe, dont certaines sont associées à des propriétés qui leur permettent d'échapper à la réponse humorale du système immunitaire ou d'augmenter la transmissibilité".
Au 5 décembre 2021, comme l'a souligné le ministère argentin de la Santé lors de la notification du premier cas local, celui-ci avait déjà été identifié dans des pays d'Afrique, d'Asie et d'Océanie ; en plus de 17 pays de l'Union européenne, dans plus de 15 États des États-Unis, du Canada et du Mexique. "Bien qu'en dehors de l'Afrique du Sud, la plupart des cas soient liés à des voyageurs, la transmission communautaire commence à être enregistrée dans de nombreux pays", ont-ils averti. Début janvier, elle prédominait déjà sur le territoire argentin. Ensuite, ce sont ses "enfants" qui se sont battus pour la première place. Aujourd'hui, aucun doute ne circule parmi nous.
« Les virus ont leur évolution naturelle dans la nature selon leurs propres caractéristiques et celles de l'hôte. L'intervention de l'être humain fait varier le cours. L'accent a toujours été mis sur l'importance qu'une grande partie de la population soit vaccinée pour prévenir l'apparition de variants préoccupants ; et nous avons pu assister à un changement dans le cours de la pandémie à mesure que le pourcentage de personnes avec plus de renforts augmentait », explique le chercheur Biglione
L'immunologue Geffner souligne : "Omicron apparaît comme une variante préoccupante, selon le nom de l'Organisation mondiale de la santé, après que les variantes Alpha, Beta, Gamma et Delta sont apparues auparavant." Mais quelle est la particularité d'Ómicron qui a donné un coup de pied au tableau de la pandémie ? "Une variante préoccupante est essentiellement définie lorsqu'elle possède trois propriétés ou l'une de ces trois propriétés : une plus grande transmissibilité, une plus grande capacité à échapper à la réponse immunitaire ou que l'évolution de l'infection est associée à une plus grande gravité", ajoute l'expert.
Là où Omicron est passé, des pousses ont surgi
« Si l'on prend par date d'apparition des symptômes et par date de décès, entre le 8 novembre 2021 et le 31 janvier 2022, soit un peu moins de trois mois, il y a eu 3 300 000 cas enregistrés et 7 500 décès. Et du 31 janvier 2022 jusqu'au dernier rapport le week-end dernier, il y a eu 970 000 cas supplémentaires et 5 700 décès supplémentaires », explique Aliaga.
Selon l'expert, il faut tenir compte, non pas du nombre de décès mais du nombre d'infections, "qu'au milieu de la montée d'Omicron, c'est-à-dire fin décembre, les gouvernements ainsi que le gouvernement fédéral Conseil de la santé (CoFeSa), ils ont décidé d'arrêter de tester les cas suspects. Bien que l'on puisse être enregistré, car il a été testé, les contacts étroits n'ont plus été testés et ils n'ont pas non plus été enregistrés. Même s'ils présentaient des symptômes compatibles avec COVID, ils n'étaient plus testés et enregistrés.
Ce qu'Aliaga décrit, ce sont les trois premiers mois d'Ómicron et après. C'est, dit-il, un appartement. "Je suis sûr qu'il y a eu beaucoup plus de cas car, évidemment, cette variante était terriblement contagieuse. D'après les preuves et ce que j'ai lu, il est faux que cette variante ait été moins dangereuse, mais qu'elle soit arrivée à un moment où nous étions majoritairement vaccinés », ajoute-t-il.
Bonvehí ajoute: «Ce qui s'est passé avec Ómicron, c'est que c'est la variante qui a produit le plus grand nombre de cas, celle qui a eu et a actuellement la plus longue durée dans le temps, contrairement aux autres variantes qui ont été rapidement remplacées. Proportionnellement, c'est celui qui a le moins de mortalité et cela a sûrement beaucoup à voir avec la vaccination.
« En Argentine, nous étions fortement vaccinés, plus de 95 % chez les plus de 50 ans, qui sont les plus susceptibles d'avoir une maladie compliquée. Donc, c'est pour ça que ça n'a pas eu autant d'impact, disons autant de morts. Il y a eu un nombre énorme de cas, pas tellement de morts », ajoute Aliaga.
Mais Omicron était exceptionnel sur un point : il a au moins 30 mutations. « Pas une ou deux comme les autres variantes, dans une protéine critique du virus, la protéine S, à partir de laquelle le virus peut infecter la cellule. Cet ensemble de mutations, tout d'abord, a donné à Ómicron une énorme transmissibilité, c'est-à-dire une énorme infectiosité », explique Geffner.
Cela signifie que lorsque Omicron a fait ses débuts, deux ou trois semaines plus tard, il est devenu la variante prédominante. « Ceci est obtenu grâce à son énorme transmissibilité, mais cela va de pair avec une deuxième caractéristique importante, qui est sa capacité à échapper à la réponse immunitaire, à la fois conférée par les vaccins et par l'infection elle-même. Évidemment, cette capacité d'évasion n'est pas absolue et c'est pourquoi les vaccins offrent une énorme protection contre les infections graves, mais pas tant contre les infections bénignes », ajoute l'expert.
Une variante qui n'en a pas donné lieu à d'autres
Pour Bonvehí, la variante Ómicron n'a pas été remplacée car, "comme il y a une grande partie de la population déjà vaccinée, cela rend plus difficile la progression du virus et peut générer des changements si importants qu'ils génèrent une autre variante différente, mais plutôt ceux les changements sont mineurs en raison de l'immunité de la population, sûrement due aux vaccins et à ceux qui ont déjà été infectés.
Geffner explique: "La vérité est que le combo de mutations qu'Omicron a dans ses différentes lignées (BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 et BA.5) et dans les nouvelles sous-lignées qui ont d'étranges noms et qui ont été récemment caractérisés, ils lui confèrent cette énorme transmissibilité et il ne devrait évidemment pas être facile pour le SRAS-CoV-2 de correspondre à un ensemble de mutations qui lui confèrent une transmissibilité encore plus grande. Je pense que c'est pourquoi, fondamentalement, jusqu'à présent, Ómicron n'a pas été remplacé par un autre, comme cela s'est produit avec les précédents. Omicron est hautement transmissible et possède ce côté supplémentaire qui lui donne la capacité d'échapper à la réponse immunitaire."
Biglione soutient que le virus continue de circuler et qu'il y a des cas de personnes qui développent une pneumonie ou qui ont besoin d'être hospitalisées. « La plupart avec des doses inférieures à celles indiquées. Si nous avons des symptômes nous savons que nous devons porter un menton pour le bien de tous. Et cet apprentissage s'adresse à toutes sortes de "froids". J'espère que nous sommes une société qui donne sa place aux médecins et à la science, qui nous ont protégés et nous ont appris la valeur d'être unis et dévoués à notre société en ces temps difficiles », dit-il.
« La semaine dernière, nous avons publié un consensus de 386 professionnels de 112 pays du monde, dont cinq Argentins, dans la revue Nature. Là, parmi les recommandations, nous avertissons que la maladie ne doit pas être sous-estimée et qu'il ne faut pas penser qu'il s'agit de la grippe. Ne pas penser que tout est résolu uniquement avec les vaccins, mais que nous devons tenir compte du fait qu'il se propage par voie aérienne et porter une attention particulière à la manière dont les inégalités sociales sont communiquées et essayer de ne pas minimiser le problème », explique Aliaga.
L'importance des renforts contre Omicron
Cette combinaison de fonctionnalités Ómicron rend très important de compléter les calendriers de vaccination. "L'Argentine a un calendrier de vaccination très important. On sera dans les 85 ou 86% de la population vaccinée avec deux doses, et ça nous place au premier niveau mondial. Cependant, lorsqu'il s'agit d'appliquer des doses de rappel, des millions d'Argentins ne les ont pas appliquées ; et ce n'est pas parce qu'ils sont anti-vaccins, parce que les deux premiers ont été appliqués, mais parce que vu que la pandémie a beaucoup moins d'impact qu'avant, en grande partie grâce aux vaccins, ils ont moins tendance à se rendre à la clinique de vaccination », explique Geffner .
« Mais il est très important de prendre la troisième dose quatre mois après la deuxième, et la quatrième quatre mois après la troisième. C'est vraiment très important car dans ce scénario, avec ces rappels, il est extrêmement peu probable qu'une personne qui contracte l'infection développe une infection grave, car le schéma complet (doses un et deux, plus rappel) offre une protection extraordinaire contre une infection grave ». , ajoute l'expert.
« La situation est différente selon les pays ou les continents, en fonction de l'accès aux vaccins et du choix individuel. Dans tous les cas, le nombre de cas graves et de décès a considérablement diminué. Cela signifie-t-il que nous sommes arrivés au bout ? Non, il y a encore des réponses à un grand nombre de questions, telles que : combien de doses sont nécessaires, tous les mois ? Est-ce similaire dans tous les cas ou patients ? Certaines études sont encore en cours et nous pourrons avoir suffisamment de connaissances, mais nous devons continuer à nous appuyer sur la science, la médecine et aussi sur la prise de conscience que chacun de nous a suscitée », ajoute le chercheur Biglione.
«Ce qui continue de se produire avec les variantes qui apparaissent, c'est ce qu'ils appellent le COVID prolongé, dans lequel la maladie laisse le corps dans un certain état dont il est difficile de se remettre. C'est une maladie qui, malgré le fait que cette année nous avons eu en février et maintenant de nombreux cas de grippe, a toujours des internats. Il y a encore plus d'hospitalisations pour le SARS-CoV-2 que pour les autres maladies respiratoires. Même malgré la vaccination puisqu'il n'y a pas tellement de cas enregistrés », ajoute Aliaga.
C'est une histoire qui n'est pas encore terminée, selon Bonvehí. « De nouvelles variantes peuvent apparaître par recombinaison de variantes précédentes. Par exemple entre Delta et Ómicron, et ils peuvent provoquer l'apparition de nouvelles variantes, mais cela est moins susceptible de se produire à un taux de couverture vaccinale plus élevé. Aujourd'hui, malgré la faible circulation, nous continuons à voir des cas de COVID dus à Ómicron, car 100% des infections dans notre pays sont dues à Ómicron, et nous continuons à voir des cas isolés, beaucoup moins qu'avant, de patients hospitalisés et , malheureusement, , de certains qui meurent, surtout dans les groupes les plus à risque », explique l'expert.
Maintenir la vaccination, appliquer les renforts et les compléter, notamment dans les populations les plus à risque, est sa recommandation. « Ces mesures sont importantes car nous ne savons pas si cette baisse transitoire que nous constatons va être définitive. Il peut y avoir des épidémies plus tard, il faut donc observer, être prudent et ne pas penser que c'est complètement fini. L'une des voies du virus est de se transformer et de rester en circulation en permanence, provoquant des cas chez les personnes à haut risque et favorisant la vaccination, peut-être, chaque année dans les groupes à risque », conclut Bonvehí.
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