Alerte à l'augmentation des cas de la variante Omicron XBB.1.5 aux États-Unis

Selon le CDC, le domaine de BQ.1 est statique tandis que XBB est en mouvement (Université du Missouri)

Si vous regardez les graphiques et les cartes des mutations faites par ceux qui suivent de près l'évolution des sous-variantes issues d'Omicron, ce que vous voyez est un véritable essaim difficile à démêler.

Dans une nouvelle édition de sa newsletter , le prestigieux scientifique Eric Topol, fondateur et directeur du Scripps Research Translational Institute, professeur de médecine moléculaire et vice-président exécutif de Scripps Research aux États-Unis, a souligné que, parmi celles qui ont émergé ces dernières mois, la plus importante d'attention est la sous- variante XBB , qui est une fusion de deux variantes différentes de BA.2, BJ.1 (BA.2.10.1.1) et BA.2.75 (BA.2.75.3.1.1.1).

Selon l'expert, dans la région de New York, XBB a évolué vers XBB.1.5, avec de nouvelles mutations, qui coïncident avec le début d'une forte augmentation des hospitalisations dans cet État. " La mutation clé de XBB.1.5 est clairement F486P, qui avait été identifiée il y a plusieurs mois par le laboratoire de Bloom comme étant liée à l'immunité d'évasion et Ryan Hisner a beaucoup écrit en août, a déclaré Topol à propos des découvertes de la soi-disant ' variant hunter' qu'il met lui-même habituellement en avant sur son compte Twitter.

Depuis quelques mois, les cartes de mutations fourmillent de nouvelles sous-variantes (Eric Topol)

Pour Topol, "de toutes les variantes du mix actuel, XBB.1.5 a le plus grand avantage de croissance sur BA.5 avec une baisse substantielle pour les autres".

Et après avoir noté que "cela se développe maintenant à New York et dans les régions du nord-est des États-Unis", l'expert a noté que "le 13 décembre, Raj Rajnarayanan (vice-doyen pour la recherche et professeur associé, NYITCOM à l'université d'État de l'Arkansas) a publié la comparaison de XBB.1.5 par rapport à BQ.1.1 dans l'État de New York met en évidence un avantage de croissance marqué.

Il a ajouté: «Dans la nouvelle surveillance génomique du CDC, vous pouvez voir l'augmentation de XBB qui a maintenant retardé le schéma de croissance de BQ.1. Autrement dit, le domaine de BQ.1 est statique tandis que XBB est en mouvement. Topol a fait référence à la surveillance génomique utilisée par les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis, qui collectent des échantillons de SARS-CoV-2 pour le séquençage dans le cadre du programme national de surveillance des souches de SARS-CoV-2, ainsi que des séquences de ce coronavirus généré par des laboratoires commerciaux ou universitaires sous contrat avec les CDC et les laboratoires de santé publique d'État ou locaux.

"Vous pouvez mieux voir cela dans les régions du Nord-Est, où XBB est déjà devenu dominant (> 50%), un bond par rapport à 35% la semaine dernière", a-t-il noté dans le post. "Bien que nous n'ayons pas les données de séquence pour dire qu'il s'agit spécifiquement de la variante XBB.1.5, toutes les indications suggèrent qu'elle mène effectivement le peloton au sein des XBB."

En accord avec ses collègues, Topol a déclaré que "si XBB.1.5 a un avantage de croissance aussi rapide sur BQ.1.1, ce n'est pas bon signe". «La semaine dernière, le laboratoire de David Ho à l'Université de Columbia a publié un article dans Cell intitulé Propriétés alarmantes d'évasion des anticorps des sous-variants BQ et XBB accrus du SRAS-CoV-2. Nous savions du laboratoire de Yunlong Cao que XBB et BQ.1.1 étaient parmi les variantes les plus évasives immunitaires observées à ce jour, mais ce nouvel article a établi que l'évasion immunitaire pour XBB.1 est supérieure à BQ.1.1 (et XBB.1.5). pas fait)."

Ce que « disent » les données disponibles

Le SRAS-CoV-2 change constamment et accumule des mutations dans son code génétique au fil du temps (Getty)

Après Singapour, qui a connu une importante vague de cas en octobre dernier, les États-Unis sont le premier pays à avoir une épidémie dans laquelle XBB devient régional dominant.

« New York est la référence pour ce qui se passe avec XBB.1.5 et ça ne s'annonce pas bien avec une augmentation marquée des hospitalisations, notamment chez les personnes âgées, ces dernières semaines alors que cette variante s'est installée —analyse Topol—. Bien sûr, d'autres facteurs y contribuent probablement, tels qu'une diminution de l'immunité, des rassemblements à l'intérieur pendant les vacances, le froid, le manque d'atténuation. Mais il convient de noter que le taux d'hospitalisation COVID de New York est son plus élevé depuis fin janvier (et dépasse également la vague Delta de l'été 2021, mais avec une certaine ambiguïté quant à la façon dont les hospitalisations étaient classées alors et maintenant) ».

Topol a noté qu'un article récent dans le New England Journal of Medicine a publié les données sur le rappel bivalent BA.5 et comment il a aidé contre XBB. "Les personnes qui ont reçu le rappel bivalent contenant BA.5 avaient une meilleure activité neutralisante contre toutes les sous-variantes Ómicron (en particulier contre BA. 2.75.2, BQ.1.1 et XBB) que celles qui ont reçu un ou deux rappels monovalents", selon le post. Et comme l'a soutenu Topol, "cette découverte d'une certaine protection contre l'immunité croisée a été étayée par des études de laboratoire sur des virus vivants menées par trois autres groupes".

Un article récent de la revue Nature affirme que

Le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, change constamment et accumule des mutations dans son code génétique au fil du temps. De nouvelles variantes devraient continuer à apparaître. Certains vont et viennent, tandis que d'autres vont continuer à se répandre et peuvent remplacer des variantes antérieures.

"Bien que nous ne sachions pas encore dans quelle mesure le boost bivalent fonctionne contre XBB.1.5, il n'y a aucune raison de penser que l'ajout d'une protection par anticorps ne serait pas utile par rapport à ne pas obtenir le boost", a déclaré Topol, concluant : "Si cela n'a pas été le cas reçu un rappel au cours des quatre derniers mois, ce serait une bonne recommandation. En plus du renforcement bivalent, il est conseillé de maintenir les mesures de soins habituelles, telles que l'utilisation de masques de haute qualité, la ventilation des environnements, la réalisation de tests en cas de suspicion d'infection, entre autres.

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